书深使用手册
按研究任务查找操作说明。
书深简介
让每一次阅读与思考,生长为下一步研究。
书深是一款以研究项目为中心的 AI 科研工作台,将文献检索、阅读批注、AI 讨论与研究结果管理连接在一起。你可以从一篇论文、一个问题开始,把分散的资料与思考逐步积累为有依据、可继续推进的研究成果。
书深能帮你做什么
- 读懂与整理文献:导入已有论文或检索新文献,在阅读中高亮、批注和记录笔记,为后续研究积累材料。
- 围绕课题开展讨论:把相关文献、笔记、数据与文档组织到项目中,引用指定材料,让 AI 比较方法、分析问题或探索研究想法。
- 让研究积累继续发挥作用:保存有用的回答、比较结果与研究笔记,结合新增材料继续核对和讨论。
为什么使用书深
- 研究在同一工作台中连贯开展:查文献、读论文、记笔记、讨论与分析衔接在一起,减少工具切换与材料搬运。
- 回答有据可查:通过回答中的引用查看来源和证据片段,回到原文核对关键表述。
- 带着已有积累继续研究:文献、项目资料和历史对话留在工作空间中,后续讨论可继续引用相关材料。
- 常用科研流程可复用:通过精确检索文献、撰写文献综述、生成科研想法等预置技能推进任务,也可添加适合自己的 Skill。
研究资料与产出可在本地保存和管理。使用云端模型或联网检索时,相关请求由所配置的服务处理。
从文献到成果
精读文献
导入本地 PDF 或 Zotero 中已有的文献,也可以描述研究问题,让 AI 查找、筛选相关论文。把值得继续阅读的材料汇集到研究项目中。

留下思考
边读边高亮、批注和记录笔记,借助 AI 理解方法、公式与图表。把一时的疑问与理解留在文献旁,为后续比较和讨论积累线索。

展开讨论
带着文献、笔记和项目资料继续追问:比较不同方法,梳理研究分歧,结合自己的条件探索值得验证的想法。

回看依据
从回答中的引用查看来源和证据,回到原文核对关键表述。将 AI 的分析与论文实际结论对照,形成自己的判断。

写成进展
将研究积累整理为带引用的综述、相关工作章节或研究报告。继续补充材料、调整结构与修改表达,让成果作为项目文件保留下来,衔接下一轮研究。

快速开始
从文献或项目出发,完成一次有材料依据的研究任务。
打开书深后,你会进入首页。我的文献 用于导入文献和继续阅读;我的项目 用于新建项目或继续已有工作。建议登录书深账号,使用可用的系统预置模型开始体验。尚未安装时,查看 安装与更新。
| 起点 | 适合的情况 | 接下来做什么 |
|---|---|---|
| 从文献开始 | 已有论文,想先整理与阅读,还没有确定项目。 | 导入文献,打开阅读,再按研究主题关联到项目。 |
| 从项目开始 | 已有课题、分析目标或明确的问题。 | 新建或打开项目,添加资料与项目文献。 |
两条路径任选其一。首次体验建议使用几篇熟悉的论文或少量资料,便于核对结果;之后可以继续导入已有文献和文件。
从文献开始
- 在首页 我的文献 区域点击 导入文献,添加本地论文 PDF、BibTeX、RIS,或从 Zotero 导入。
- 进入 文献全览,查看已导入的文献,打开一篇论文阅读、标注并记录笔记。
- 需要围绕课题讨论或分析时,返回首页创建项目,再在项目文献库中关联所需的已有文献。

不必先建项目再整理文献。全局文献库用于积累个人文献,项目文献库用于组织当前课题需要的部分。
具体操作见 导入与管理文献。
从项目开始
- 在首页 我的项目 右侧点击 新建项目,填写名称并创建;已有项目可直接点击卡片进入。
- 在项目 资料库 中导入本地文件或文件夹,汇集笔记、数据与文档,作为后续讨论和分析时可引用的材料。
- 在 项目文献库 中导入论文、关联全局文献库中的已有文献,或通过 发现新文献 检索课题需要的论文。

左上角项目菜单支持返回 首页、切换已有项目和 新建项目。项目卡片与管理操作见 项目与工作台。
导入资料时,复制到项目 会保留独立副本;关联本地原文件 会直接使用原文件,修改也作用于原文件。材料如何放置,见 导入与使用资料。
打开 AI,引用材料并选择模型
进入项目后,打开 书深 AI。建议先登录账号,在输入区选择可用的系统预置模型;需要接入自己的模型时,查看 模型与账号。

通过 “+”或“@” 引用本次要使用的文献、笔记或文件,并说明研究问题。材料加入项目后,不代表每次回答都会自动使用全部材料。
完成一个小任务
首次体验可引用两篇熟悉的论文,发送:
请基于我引用的这两篇论文,比较研究问题、方法和主要结论,用表格整理,并标明依据来源。
也可以引用自己的研究笔记或文档,发送:
请基于这份研究笔记,整理已经明确的结论、尚待验证的问题,以及下一步需要补充的材料。区分笔记中的信息与你的建议。
需要推进完整科研任务时,可选择 精确检索文献、撰写文献综述 或 生成科研想法。任务需要补充信息或确认时,按提示回复。

核对结果,保存并继续
- 阅读回答,点击来源编号查看引用片段,回到原文核对关键结论。
- 对不清楚的部分继续追问,或补充材料,要求 AI 调整分析与表达。
- 将有用的回答或生成文件导入资料库,后续讨论与分析时继续引用。

AI 修改文件后,进入修改审阅,检查后决定是否保留。同一研究问题可以在原对话中继续;独立的问题可另建对话。
完成后,你应得到一份核对过的比较表、研究笔记或其他可继续使用的结果。更多操作见 保存研究结果。
安装与更新
安装书深,打开首页,开始积累文献与研究项目。
安装桌面应用
从书深官网下载适合当前系统的安装包,完成安装后打开应用。进入首页后,可以先导入文献,也可以新建项目。
建议登录书深账号,使用可用的系统预置模型体验。具体步骤见 快速开始。
通过命令行启动
安装 Node.js 和 npm 后,在终端执行:
npx @damodi/scholarseed更新应用
查看应用内更新提示,或使用 检查更新。按提示下载后,选择 重启完成更新。
下载或安装失败时,根据错误提示重试。开发构建的更新方式与发布安装包不同。更多说明见 偏好设置与常见问题。
项目与工作台
项目是组织一个课题的工作空间,将项目文献、资料与 AI 对话联系在一起。工作台用于打开、阅读和处理其中的内容。
全局文献库积累个人文献,项目文献库汇集当前课题需要的论文;资料库保存笔记、数据与文档。按任务引用这些材料,让 AI 参与比较、分析与讨论。
创建与切换项目
新用户进入书深后,首先看到 首页。首页的 我的文献 展示最近打开的文献及文献数量,并提供 导入文献 入口;我的项目 集中展示已有项目。
每张项目卡片包含项目名称、最近修改时间、存储路径,以及资料和文献数量。点击卡片进入项目,继续处理其中的资料、文献和对话。
- 创建项目:点击首页 我的项目 右侧的 新建项目,填写项目名称并创建。
- 打开已有项目:在首页的项目列表中点击对应卡片。
- 返回首页或切换项目:打开左上角项目菜单,选择 首页 或已有项目;菜单底部也提供 新建项目 入口。
项目切换后,资料、关联文献和对话随之切换。原项目中已经保存的内容继续保留。

一个项目包含什么
每个项目都有自己的资料、文献和 AI 对话,围绕同一个课题集中管理。
- 资料:当前项目使用的笔记、数据、文档、代码与研究产出,在项目资料库中组织和使用。
- 文献:当前课题需要的论文,在项目文献库中导入、关联和阅读。
- AI 对话:围绕当前项目开展的提问、回答与任务过程,可以在该项目中回看和继续。
这些内容按项目隔离。切换项目时,资料库、项目文献库和 AI 对话会一起切换到所选项目,不会混在同一个项目列表中;切回原项目后,可以继续之前的研究。
全局文献库用于积累个人文献,同一篇文献可以关联到多个项目。每个项目只展示与自己关联的文献。
打开与切换内容
点击资料、文献或生成文件,在中间工作区打开。通过顶部标签页切换内容,右侧 书深 AI 用于提问与查看任务。
右键点击标签页,可关闭当前、其他或全部标签页,也可选择 拆分右侧 或 拆分下方,同时查看多份内容。

关闭标签页只关闭当前视图。文件有未保存内容时,先按提示处理。
继续历史对话
在 AI 标题栏打开 历史对话,选择原会话继续提问。需要单独讨论新问题时,新建对话。
补充新文件或调整材料后,检查输入区的引用,再发送下一条消息。
重命名、归档与恢复项目
在首页 我的项目 中,点击项目卡片右上角的 “…”,选择 重命名,修改项目名称并保存;选择 归档,可将暂时不用的项目从首页与各处默认列表中收起。归档后,文件与对话保留。

打开 设置 → 归档管理,找到已归档的项目:点击 取消归档,将项目恢复到首页与默认列表;不再需要的项目可点击 永久删除,按界面提示完成操作。

查找项目中的材料与会话
打开顶部搜索入口,输入文件名、论文标题或记得的对话关键词。先确认当前项目,再查看资料、文献与会话结果;点击结果打开对应内容。
找已有论文时使用项目内搜索,找尚未入库的论文则使用文献库的 发现新文献。找不到某次分析产物时,可以先搜索生成它的历史对话,再从回答中的文件卡片打开。

阅读时随时向 AI 提问
阅读论文或资料时,随时点击 书深 AI 打开右侧对话。打开时会默认引用当前文件,你可以直接围绕正在阅读的内容提问,例如解释一段文字、分析图表或核对数据。

需要结合更多材料时,通过输入区的 “+”或“@” 添加其他文献、笔记或文件,也可以在文件标签页的右键菜单中选择 加入当前对话。发送前查看输入区的引用,确认本次提问使用的材料。
你可以保留文件阅读区域,一边查看原文,一边向 AI 追问;围绕同一个问题继续当前会话,需要单独研究新问题时再新建对话。
下一步
文献检索
从具体论文或研究问题出发,发现相关研究、筛选候选文献,并获取可用于阅读与核对的材料。
选择检索方式
已知题名、作者或关键词时,使用文献库的 发现新文献;需要围绕研究问题寻找证据、比较方向或限定筛选条件时,使用 精确检索文献 Skill。
在文献库中检索
- 打开文献库的 发现新文献。
- 输入题名、作者或关键词,开始检索。
- 核对候选论文的信息和全文状态,将需要的条目加入文献库。

用精确检索文献推进研究问题
适合开题时梳理已有工作、围绕某种方法寻找论文,或为综述补充特定方向的证据。检索的目标是找到与问题相关、值得继续阅读的文献。
在书深 AI 中选择 精确检索文献,说明研究问题、对象、时间范围和筛选条件。已有参考论文、课题说明或研究笔记时,可通过“+”或“@”一并引用。
我想了解大气湍流预测如何用于星地光通信链路调度。请优先寻找近五年直接评估调度收益的研究,区分仅做预测与实际用于调度的方法,并标明全文是否可获取。
按任务提示补充条件,查看候选文献及其相关性说明,选择需要深入阅读的论文,再继续获取全文。需要调整范围时,在原对话中补充要求。
预期得到的是候选文献、题录、筛选依据与可获取的全文。全文状态和实际检索结果以任务返回为准;保留原对话,便于回看检索条件与选择过程。

把模糊方向变成检索条件
不确定关键词时,先描述研究对象、希望解决的问题和已有线索。已有代表论文时,可提供题名或引用条目,让任务围绕它补充相关工作。
| 条件 | 示例 |
|---|---|
| 研究对象 | 星地光通信链路中的大气湍流。 |
| 要回答的问题 | 预测结果是否真正改善链路调度? |
| 优先范围 | 近五年,有实验或仿真评价的研究。 |
| 排除范围 | 仅预测湍流、未评价调度收益的论文不作为主要候选。 |
| 输出要求 | 列出题名、年份、相关性、评价指标与全文状态。 |
不必一次填满所有条件。先给出确定的信息,再按任务提问补充;若条件过窄,可以先放宽年份或方法限制。
筛选与核对结果
- 是否相关:标题与摘要是否直接涉及研究问题。
- 是否符合范围:年份、研究对象、方法与实验条件是否匹配。
- 是否有可核对依据:区分题录、摘要与完整原文,不把摘要信息当作全文证据。
根据候选结果继续检索
先看相关性说明,再决定保留哪些论文。结果偏离问题时,指出具体偏差,例如“这些论文只讨论预测精度,请继续找评价调度收益的工作”。结果太多时,补充对象、方法或证据要求。
发现重要论文后,可在原对话中要求围绕它补充相关研究,并说明哪些条目已经看过。继续检索时保留原条件,新增条件单独写明,便于检查筛选标准是否发生变化。
判断本次检索是否够用
检查主要子问题是否都有相关文献、代表性方法是否被覆盖,以及核心判断是否有可读取的原文支持。仅有题录或摘要的条目可以作为阅读线索,暂时不要据此比较原文未披露的实验细节。
选中的论文继续加入文献库并关联项目。检索记录保留在原对话中;阅读与标注见 阅读与标注。
获取全文并继续研究
在文献详情中检查全文状态,使用 获取全文,或通过 上传全文 PDF 补充本地文件。获取失败时按提示处理。

导入与管理文献
导入已有论文,整理题录、附件、分类和标签。
选择导入方式
在文献库打开 导入文献,选择对应入口。
| 来源 | 操作 |
|---|---|
| 本地 PDF | 选择论文文件,查看逐个上传与解析结果。 |
| BibTeX、RIS | 选择题录文件,导入文献信息。 |
| Zotero | 连接本机 Zotero,选择要导入的分类。 |
| 文献全览 | 在项目中关联已有文献。 |
导入题录不等于获取全文。打开文献详情,可继续添加 PDF 或补充附件。
从 Zotero 导入
- 打开本机 Zotero。
- 在 Zotero 设置中允许本机其他应用与 Zotero 通信。
- 回到书深,选择分类,决定是否保留分类结构。
- 开始导入并查看结果。

每次导入会新增文献,不自动与已有条目合并。重复导入前,先检查已有内容。
处理导入结果
PDF 导入后,逐项查看解析状态,打开详情核对题名和作者。题录不完整时继续补全;解析失败的文件保留原件,按错误提示重试。

BibTeX 和 RIS 主要带入题录。导入结束后检查全文状态,需要阅读的论文继续获取全文或上传 PDF。Zotero 导入是一次导入操作,不应当作与 Zotero 持续双向同步。
把已有文献关联到项目
先进入目标项目,再从项目文献库选择关联已有文献。找到文献全览中需要的条目,完成关联后,在当前项目列表检查结果。

同一文献可用于多个项目。开始整理前,先辨认自己正在查看文献全览还是项目列表,避免把当前项目范围误认为全部文献。

按课题组织分类与标签
分类适合组织稳定的研究方向,例如“预测方法”“调度策略”;标签适合补充交叉主题或个人阅读状态,例如“待读”“重点方法”。可以组合使用,先缩小范围再打开论文。

整理完后,检查项目关联和分类是否符合预期。删除分类不会等同于删除其中的论文;移除项目关联与删除文献也要按确认提示分别判断。删除前核对对象和影响范围。
补全题录与附件
打开 文献详情,检查标题、作者、年份、出版物和标识信息。字段不完整时,可编辑信息,或使用 同步元数据 补全。

按标题查询得到匹配结果时,先确认是同一篇论文,再填充。附件页用于上传、打开和管理全文及补充文件。
导出题录
选中文献,使用 导出 bib,选择保存位置。导出的 BibTeX 文件可用于后续参考文献管理。

导出前检查题录
先核对作者、年份、出版物和 DOI,再选中需要的文献导出 BibTeX。导出题录用于交换文献信息,不包含论文全文与全部阅读记录。导出后打开文件检查条目数量与关键字段。
阅读与标注
阅读论文原文,使用翻译、AI 解读、标注与笔记整理认识。
打开论文
在文献库打开已有全文的论文。使用阅读器工具栏翻页、缩放、调整页面宽度或搜索文字。

扫描页没有可识别文字时,不能直接选择或查找文字。
标注与局部提问
选中原文后,按需要高亮、批注、翻译或使用 AI 解释。选择 添加到对话,可带着原文片段继续提问。

标注保留在对应文献下,方便再次阅读时定位。
翻译原文
打开翻译面板,选择翻译方向,按需要处理当前页或全文。先用当前页确认效果,再继续阅读其他部分。术语、公式符号和关键结论应与原文对照。

只需要理解一句话时,选中该段使用局部翻译;需要进一步解释方法假设时,将片段添加到对话,补充自己的问题。
用 AI 解读和图表解释深入阅读
AI 解读适合先了解论文的研究问题、方法和结论,再回到原文细读。看到感兴趣的判断时,检查对应依据,不要只停留在概括结果。

解释图表时,点击 图表解释,框选图表及图注。尽量保留坐标轴、图例、单位和实验条件,再说明希望理解的内容。
请解释这张图中各条曲线的含义,说明横纵轴、实验条件,以及它能支持什么结论。看不清的数值请明确指出。

回看与管理标注
阅读时用高亮标记原文,用批注记录自己的疑问和判断。再次打开论文后,查看已有标注并定位原文;需要修改理解时,编辑对应批注,避免只在新的对话中留下更正。
一条批注聚焦一个问题,例如“此实验是否控制了数据量?”;整篇论文的认识放在阅读笔记中。这样便于区分原文证据与自己的推断。

记录阅读笔记
在文献的笔记入口新建笔记,记录原文要点、自己的理解和待解决问题。引用原文时保留出处,便于后续核对。
查看回答来源
点击回答中的来源编号,查看引用片段与页码,再打开对应原文。摘要、阅读笔记和论文全文所能支持的判断不同,应按实际读取范围使用。

导出带批注的 PDF
在 PDF 阅读器工具栏使用导出入口,选择保存位置,导出带批注的副本。打开导出文件,检查批注位置和内容是否符合预期。
带批注 PDF 用于保留阅读标记;独立阅读笔记和历史 AI 对话应在各自入口查看,不要将它们视为全部打包进 PDF。
带着阅读积累继续提问
选中需要讨论的原文,使用 添加到对话;同时引用相关论文或项目笔记,写清希望比较的维度。将核对后的结论补入笔记,后续研究继续引用。

比较这两篇论文对同一问题的假设。请区分原文明示的条件、我的批注,以及还需要验证的判断。
导入与使用资料
将文档、数据和文件夹加入项目,用于阅读、整理和 AI 对话。
先决定导入位置
论文的题录、全文、附件与阅读记录放在文献库;课题说明、实验数据、代码、笔记与其他文档放在项目资料库。已有论文需要参与多个项目时,优先在文献库中关联,便于集中管理。
导入文件或文件夹
在资料库点击 导入资料,选择文件处理方式,再选择或拖入本地文件与文件夹。
| 方式 | 文件如何保存 |
|---|---|
| 复制到项目 | 在项目中保存独立副本,原文件不变。 |
| 关联本地原文件 | 直接使用原位置的文件,编辑会作用于原文件。 |

关联文件被移动或删除后,书深可能无法继续访问。重新关联可访问的文件后再使用。
整理资料
在资料库中创建文件夹或 Markdown 文档。通过文件菜单重命名、移动或删除条目,也可在系统文件管理器中查看所在位置。

支持的文件类型
| 类型 | 工作台中的操作 |
|---|---|
Markdown(.md、.markdown) | 预览、编辑和保存。 |
| 纯文本、代码、JSON、JSONL、YAML、TOML、XML、HTML、CSS | 查看和编辑源文本。 |
| 预览、标注;有文字层时可查找和选择文字。 | |
Word(.doc、.docx) | 预览和选择文字。 |
CSV、Excel(.csv、.xls、.xlsx) | 预览表格。 |
| TSV | 以表格形式查看。 |
PowerPoint(.ppt、.pptx) | 预览幻灯片、切换页面。 |
| PNG、JPEG、WebP、GIF、SVG | 预览图片。 |
编辑与保存文件
打开 Markdown 或支持编辑的文本文件,修改后保存,再让 AI 使用新内容。离开页面前检查保存状态;自动保存是否开启,可在 设置 → 资料库文件 中查看。

Office 和表格预览用于查看已有内容。需要编辑原文件时,可在相应应用中打开;返回书深后核对刷新结果。
文件在外部应用中变化时,先核对刷新或冲突提示,再决定如何保留修改。
取消关联与删除
关联本地文件后,取消关联用于移除项目中的连接,保留原文件。删除操作则需要查看确认框中说明的对象和处理方式,不要将二者混用。
处理同名文件时,先比较位置和内容,再按导入提示选择处理方式。关联文件失效时,检查原文件是否移动、重命名或删除,恢复可访问的位置后再引用。
让 AI 使用资料
通过 AI 输入区的 “+”或“@” 引用文件或文件夹。针对局部内容,可选中文字后使用 问 AI 或 添加到对话。
说明需要分析的问题、输出形式和材料范围。数据文件还应说明字段含义、单位与缺失值。

继续使用资料
搜索网页资料
围绕课题寻找网页、技术说明和相关资料,核对来源后加入项目。
描述要找的内容
在资料库的 发现新资料 中输入需求。写清研究对象、材料类型和用途,比只输入宽泛主题更容易检查结果。
查找星地光通信链路预算的公开技术说明,优先保留包含参数定义、计算方法和发布机构的资料。
寻找学术论文时,使用 文献检索;这里用于补充其他研究材料。
核对来源与内容
打开检索结果,检查发布者、日期、原始链接和正文是否回答问题。摘要仅用于初步判断,需要引用的结论应回到来源页确认。

网页打不开或只有部分内容时,不把搜索摘要当作完整资料。换用可访问来源,或补充自己已有的本地文件。
保存到项目
选择需要的结果,按入口提示保存到当前项目。完成后在资料库中打开,检查内容和来源信息;按主题整理到文件夹,避免只保留难以辨认的标题。
引用到 AI 对话
通过“+”或“@”引用保存的资料,说明分析目标。需要和论文一起比较时,同时引用相关文献,并要求区分网页说明与论文证据。
保存的材料用于保留本次参考内容。来源网页可能更新,再次使用关键数据时可回到原链接核对。
保存研究结果
将有用的回答、比较表和生成文件留在项目中,供后续研究继续使用。
保存回答片段
选中回答中的内容,使用 导入回答到资料库,完成后在资料库中打开检查。保留研究问题、适用条件和来源线索,方便日后理解这段结论。

保存前先核对关键判断。对仍有疑问的内容,标明待验证问题,不要与已核对结论混在一起。
保存生成文件
从回答中的文件卡片打开产物,检查内容后选择 导入到资料库。需要放到其他位置时,在更多操作中使用 另存为。

导入会保存副本,原产物继续保留。后续引用时认准项目中的副本,避免把两份文件当成同一份。
AI 已直接写入项目目录的文件,可从对应位置打开,无须重复导入。有待审阅改动时,先完成 文件修改审阅。
让结果参与下一次研究
将结果按课题整理,使用能辨认内容的名称。下一次提问时引用该文件,并补充新增材料和本次目标。
这是上次的方法比较和新加入的两篇论文。请检查哪些判断需要更新,并说明新增依据。
历史对话保留讨论过程,项目文件保存需要反复使用的结果。文件后续发生变化时,可在 版本历史 中查看已记录的内容。
检查 AI 文件修改
AI 新建或修改文件后,核对实际变化,再提交保留决定。
打开本轮改动
从对话中的审阅入口打开文件列表,确认涉及哪些文件。修改可能已经写入磁盘,停止任务不会自动撤销这些变化。
逐个打开文件:支持文本差异的格式可以对照修改前后;其他格式检查完整文件。重点核对内容是否符合要求、无关部分是否保留、数据与来源是否准确。

选择处理方式
| 选择 | 如何处理 |
|---|---|
| 接受 | 保留本轮修改。 |
| 拒绝 | 按审阅范围恢复修改前内容;新增文件的处理以确认提示为准。 |
| 修订 | 在支持的编辑界面调整后,提交修订结果。 |
选择某个决定后,继续处理其他文件。检查整批文件的决定,再执行提交;仅点击某个文件的选择,不代表整批审阅已经完成。

确认提交结果
提交后检查是否仍有待处理文件。若整批改动都不需要,可使用界面提供的整批撤销操作,并核对执行结果。
系统提示存在待审阅改动时,先处理这批内容,再发起下一轮涉及文件修改的任务。不要用新任务掩盖未完成的审阅。

处理内容变化与失败
文件被其他应用修改时,当前内容可能与审阅快照不同。先刷新并核对实际文件,再决定接受、拒绝或修订。
提交失败时保留当前页面,查看具体原因并重试。只有操作成功后,才将本批次视为完成。历史版本的查看和恢复见 查看与恢复文件版本。
查看与恢复文件版本
查看文件已记录的历史,比较变化,必要时恢复较早内容。
区分保存与版本记录
保存用于把当前编辑写入文件;版本记录用于保留可以回看的历史。文件已经保存,不代表每一次修改都有独立版本。
是否保存历史取决于版本管理范围、文件大小和访问状态。没有记录的内容不会自动出现在历史列表中。
查看历史与差异
在资料库文件菜单中打开 版本历史,选择一条记录,查看对应内容。支持对比的文件可以与当前版本比较,先确认差异再决定是否恢复。
核对文件路径、记录时间和内容,避免只凭时间判断某个版本就是需要的结果。


恢复需要的版本
先处理当前未保存内容,再选择恢复并查看确认提示。恢复作用于对应文件,不是只撤销某一句话或整场对话。
完成后重新打开文件,检查内容。遇到外部修改或冲突提示时,先核对当前文件;操作失败时不要把恢复当作已完成。

设置历史保留范围
打开 设置 → 资料库文件,设置文件自动保存、保存时自动格式化、版本数量和最大文件大小。开启自动保存后,编辑文件并离开编辑区域时会自动保存;关闭后需手动保存。
超过版本数量上限时,系统会自动清理最早的历史版本;超过最大文件大小限制的文件不会自动保存历史,大小单位为 MB。

没有找到历史记录
依次检查文件是否纳入版本管理、是否超过大小限制、是否可访问,以及旧记录是否已经被清理。版本历史只覆盖实际记录的内容,不能用来恢复从未保存的历史。
AI 对话与材料引用
选择模型、引用材料,查看任务过程并继续追问。
开始对话
打开 书深 AI,选择模型,写明问题和输出要求后发送。需要单独处理新问题时,使用标题栏的新对话入口。
切换模型对下一条消息生效,正在生成的回答继续使用原模型。

引用材料
通过输入区的 “+”或“@” 选择资料、文献或历史对话。发送前检查引用,移除不需要的内容。
| 引用内容 | 使用方式 |
|---|---|
| 文件或文件夹 | 指定需要读取的项目材料。 |
| 文献或文献合集 | 围绕论文进行解释、比较和分析。 |
| 历史对话 | 结合已有讨论继续工作。 |
| 文字片段或表格选区 | 针对局部内容提问。 |
手动引用用于明确重点。如果只允许使用指定材料,在问题中写明范围。

查看任务过程
在原对话中查看检索、读取文件和生成结果等过程。任务需要补充信息、选择候选或确认大纲时,按提示回复。
执行中的新消息可能进入待处理列表。检查列表中的内容,移除不再需要执行的消息。
点击 停止 后,已有结果和已完成的文件修改仍保留。文件改动需要在修改审阅中处理。
核对并继续追问
点击回答中的来源编号,查看依据并回到原材料。只有摘要、片段或部分全文可用时,按实际读取范围核对结论。
针对局部内容,选中回答片段并 添加到对话,补充修改要求后发送。继续原问题时留在同一会话;查找以前的讨论时打开 历史对话。
保存有用的结果
选中回答文字,使用 导入回答到资料库。生成文件可从回答中的文件卡片打开,再保存到资料库。
管理本轮引用
发送前确认材料名称和范围。比较两篇论文时同时引用两篇;分析实验结果时同时提供数据和字段说明。引用文件夹时写清任务,让 AI 围绕问题寻找相关文件。
引用区表示你提供的材料,来源编号表示回答中可回溯的依据,二者不是同一件事。引用论文条目后,仍要检查全文是否可用以及实际读取范围。
切换工作区文件后,检查引用区,不要假定当前打开的文件已自动替换旧引用。文件有新修改时先保存,再让 AI 使用新内容。
带着已有讨论继续
同一问题在原会话中继续;需要结合另一段讨论时,通过引用入口选择历史对话,再补充本次目标。新建会话后重新检查材料,不把上次输入区的状态当作本次已具备的上下文。
请结合这段历史讨论和新增实验记录,检查原先的判断是否仍成立,分别列出保留、调整和待验证的结论。

处理等待、停止与失败
| 看到的状态 | 下一步 |
|---|---|
| 等待补充信息或选择 | 在原对话中回答,明确选择或补充条件。 |
| 请求执行权限 | 查看请求的操作与范围,再按实际任务决定。 |
| 新消息待处理 | 检查是否仍需要执行,移除过时或重复要求。 |
| 已停止 | 检查已有回答、文件与待审阅改动,再说明从哪里继续。 |
| 执行失败 | 查看具体错误,检查模型、网络或材料状态后重试。 |
恢复任务时说明已完成的部分和下一步要求,避免重复生成相同结果。文件改动通过 检查 AI 文件修改 处理。
让问题更容易回答
明确问题、材料范围和输出形式。一般解释直接提问;需要完整研究流程时选择 预置科研 Skill。
只依据这两篇论文,按研究对象、方法假设、数据要求和评价指标做比较表。原文未说明的内容标为未说明,不补猜测。
预置科研 Skill
根据研究目标选择可复用的任务流程。日常解释和局部比较可直接对话,需要连续检索、筛选或研究分析时使用 Skill。
选择适合的任务
| 你的目标 | 选择的 Skill | 详细说明 |
|---|---|---|
| 为研究问题寻找相关论文与证据 | 精确检索文献 | 文献检索 |
| 围绕主题组织文献与综述分析 | 撰写文献综述 | 使用文献综述 Skill |
| 从已有研究中探索可验证的问题 | 生成科研想法 | 生成科研想法 |
启动任务
在新对话中选择对应任务入口,或在输入区输入 “/” 选择 Skill。通过 “+”或“@” 引用论文、笔记和其他材料,再说明目标与约束。
先说明希望解决什么问题,再说明结果形式;材料不完整时明确指出。任务要求补充信息或确认选择时,在原对话中回复。

继续与检查任务
执行过程中查看当前进度,按提示确认范围、候选或方案。调整目标时说明哪些条件保持不变,哪些需要更新。
结果出来后,检查来源、材料覆盖范围和未解决问题。保留有用结果,继续引用和讨论;不要将生成的研究想法当作已经验证的发现。
安装、启用与删除技能见 添加与管理 Skill。
使用文献综述 Skill
使用预置的 撰写文献综述 任务,围绕研究问题整理文献、组织论述并检查引用。本章仅介绍该 Skill 的任务流程。
准备主题与材料
说明研究问题、覆盖范围、语言、篇幅和引用要求。有已有论文时一并引用;需要补充检索时,说明希望补足的方向。
围绕星地光通信中的湍流预测与链路调度整理研究进展。区分预测精度评价与调度收益评价,先确认范围和文献,再给出大纲。仅有摘要的论文单独标明。
启动并确认范围
在书深 AI 中选择 撰写文献综述,或通过“/”选择该技能。按任务提示补充主题与条件,避免将多个不相关的研究问题放在同一次任务中。

检查文献和大纲
核对候选文献是否覆盖核心问题,区分候选条目、纳入分析的论文和最终引用文献。需要删减时说明理由,例如对象不匹配、研究时间超出范围或缺少关键依据。
确认大纲时,检查章节是否围绕研究问题组织,是否包含方法比较、分歧与尚未解决的问题。需要调整结构时,在原对话中明确回复。

核对输出
检查综述结果中的每个主要判断是否有对应来源,参考文献信息是否准确。涉及实验细节的结论要回到全文;缺少全文时按实际可读取的材料判断。
需要调整时,指出具体章节、问题和补充材料,在原任务中继续。可保留大纲、综述结果和相关文件,供后续研究参考。
保存与继续
通过回答中的文件卡片打开结果,检查后导入资料库。下一轮研究补入新文献时,引用已保存结果并说明需要重新核对的部分。操作见 保存研究结果。
生成科研想法
结合已有文献、观察和研究条件,探索值得继续验证的问题。
什么时候使用
读完一组论文但不确定下一步做什么,或已有一个初步想法、希望明确依据与验证路径时,可以使用 生成科研想法。
如果目前缺少对相关研究的基本了解,先通过 文献检索 补充材料,再展开讨论。
准备研究背景
引用代表论文、研究笔记或已有结果,说明关注的问题,以及可用的数据、设备和时间。明确哪些观察已有证据,哪些只是猜想。
结合这些论文和现有实验数据,探索值得验证的研究问题。请说明与已有工作的关系、关键假设、最小验证步骤,以及数据不足时如何缩小问题。

启动与选择方向
在书深 AI 中选择 生成科研想法,或通过“/”选择对应技能。按提示补充背景;看到候选方向后,选择符合兴趣和研究条件的方向深入。
不必同时推进所有建议。优先选择问题清楚、已有依据、验证条件可满足的方向。

把想法变成验证问题
| 检查点 | 需要弄清楚的内容 |
|---|---|
| 研究问题 | 希望解释或改善什么,针对什么对象? |
| 已有依据 | 哪些论文、观察或数据支持提出这个问题? |
| 可能差异 | 与相关研究相比,准备改变什么? |
| 关键假设 | 哪个假设不成立时,方案就需要调整? |
| 验证方式 | 第一步用什么数据、对照和指标检查? |
| 可行条件 | 当前缺少什么,能否缩小范围先验证? |
继续检索和讨论
围绕选定方向补充相关研究,检查相似工作,再讨论验证条件。生成的想法不代表创新性已得到证明,验证方案也不代表实验已经完成。
把选定的问题、依据、待验证假设和下一步行动保存到资料库;后续有新结果时,引用这份记录继续讨论。
添加与管理 Skill
Skill 将任务说明和执行流程组织为可复用的技能。
查看技能
打开 设置 → 技能,按名称搜索或查看 系统预置 与 我的。点击 查看,了解说明和使用要求。
系统预置技能默认开启,不可关闭;内置技能不能修改或删除。

添加技能
- 点击 添加技能。
- 选择
SKILL.md或技能 ZIP 包。 - 检查文件并点击 安装。
安装成功后,技能加入 我的,默认启用,在本机所有项目中生效。同名技能需要修改名称或确认覆盖安装。

在对话中使用
在 AI 输入区输入 “/” 选择技能,或按技能说明描述任务。需要使用项目材料时,通过 “+”或“@” 一并引用。
技能是否能完成任务,还取决于所需模型、服务、文件和运行环境。缺少条件时,按任务提示补充。
停用与删除
对自己安装的技能,可以停用或删除。删除会从本机所有项目的可用技能中移除,后续需要重新安装才能使用。
更多说明:预置科研 Skill · 模型与账号

模型与账号
连接模型服务,管理登录状态与平台用量。
选择接入方式
| 方式 | 配置 |
|---|---|
| 书深内置模型 | 登录账号后,选择已开通的模型。 |
| 自有模型服务 | 配置供应商、服务地址和 API Key。 |
| 本地模型服务 | 启动本地服务,通过自定义连接填写兼容接口地址。 |
配置模型服务
- 打开 设置 → 模型服务。
- 选择厂商或添加自定义连接。
- 填写服务地址与所需凭据,连接或测试服务。
- 读取模型列表,勾选需要使用的模型并保存。
服务没有提供模型列表时,按界面提示填写模型名称。PDF、图片等输入支持按供应商实际提供的功能配置。

在对话中切换模型
点击 AI 输入区的模型名称,选择其他可用模型;需要时调整思考强度。
切换后,下一条消息使用新模型,正在生成的回答不受影响。

登录与查看用量
从头像菜单进入登录,完成账号验证后返回应用。账号相关入口用于查看平台积分和用量,具体记录以账号页面为准。
使用自己的模型服务时,用量按对应服务处理。遇到任务不可用的提示,分别检查账号、所选模型和服务连接。


偏好设置与常见问题
调整个人偏好,处理常见问题并获取帮助。
个人设置
在设置中调整语言、外观和通知。界面语言不会自动翻译文件或已有对话;需要 AI 使用指定语言时,在问题中说明。
在 关于书深 中查看版本、官方入口和新手引导。
安装与升级操作见 安装与更新。

常见问题
| 问题 | 处理方式 |
|---|---|
| 没有可选模型 | 检查登录状态、模型连接是否启用,以及模型是否勾选并保存。 |
| AI 没有使用指定材料 | 检查输入区引用和文件可读性,补齐材料后重新提出要求。 |
| 文献只有题录 | 在详情中获取全文或上传 PDF。 |
| Zotero 连接失败 | 确认 Zotero 已打开,并允许本机应用通信。 |
| 关联资料打不开 | 检查原文件是否被移动、删除或变得不可访问。 |
| 任务等待中 | 查看是否需要补充信息、确认选择或完成授权。 |
| 文件保存或审阅失败 | 查看具体错误,检查文件位置、权限与冲突,再重试。 |
反馈问题
从头像菜单打开 问题反馈,填写操作步骤、预期结果和实际结果。提交前检查附带的截图、日志和对话记录,保留本次排查需要的内容。

卸载桌面应用
退出书深,按操作系统的应用卸载方式移除桌面程序。
卸载程序与删除研究文件是不同操作。项目文件、关联的本地原文件和账号应分别处理;不要把移除应用当作清理全部数据的结果。
设置局部 AI 提示词
打开 设置 → AI 提示词,查看划词操作对应的提示词。可根据常用阅读方式调整解释或翻译要求,再保存。需要恢复时使用恢复默认入口。
这些设置跨项目生效并在重启后保留;一次任务的临时要求仍在当次操作中补充。修改后用熟悉的材料检查效果,再决定是否长期使用。

文件自动保存与历史设置
在 设置 → 资料库文件 中检查自动保存、版本数量、文件大小和历史保存范围。自动保存处理当前文件,版本管理决定哪些历史可回看,二者分别检查。
操作方式见 查看与恢复文件版本。归档项目的恢复和永久删除在 设置 → 归档管理 中处理。

带着有效信息反馈问题
反馈前记录应用版本、操作入口、所选模型和错误提示。说明从哪一步开始异常,以及是否能重复出现;文件问题补充格式和保存方式,检索问题补充检索条件和失败阶段。
这样可以区分模型连接、材料访问与操作流程问题,减少反复补充信息。